依据现有的文献经验，在检测细胞器方面，通常有两种方式，一种是将细胞器提取出来以后，对线粒体直接进行检测。当然这是最直接的方式，不过同时也存在一定的技术难度，目前有测试单个液泡的文献。

      另外文献中还有一种方式是利用了生物材料本身的特性来实现检测。就线粒体而言，比如有一些细胞有天然的线粒体富集区，也就是细胞的某一区域富含线粒体，如烟草花粉管的碱化区，检测这一区域即可以间接的反映线粒体的生理活动。